Tóquio se transformou em uma zona de risco, a morada das Divindades. Waka, a garota que jurou “matar as Divindades”, é forçada a lutar contra Nayuu, um organismo artificial criado pelo Instituto de Ciências Antidivinas. Ciente de que dentro de Waka e spreita uma brutalidade incontrolável, Tokinaga sugere que ela passe a morar fora do Instituo, porém, eventos inesperados acontecem…?